知識產(chǎn)權海關(guān)保護備案，是指知識產(chǎn)權權利人，按照《知識產(chǎn)權海關(guān)保護條例》的規定，將其知識產(chǎn)權的法律狀況、有關(guān)貨物的情況、知識產(chǎn)權合法使用情況和侵權貨物進(jìn)出口情況以書(shū)面形式通知海關(guān)總署，以便海關(guān)在對進(jìn)出口貨物的監管過(guò)程中能夠主動(dòng)對有關(guān)知識產(chǎn)權實(shí)施保護。 
根據1995年頒布的《知識產(chǎn)權海關(guān)保護條例》，知識產(chǎn)權備案是知識產(chǎn)權權利人向海關(guān)尋求保護的前提條件。2003年12月修訂的《知識產(chǎn)權海關(guān)保護條例》對此進(jìn)行了修改，不再要求知識產(chǎn)權權利人在向海關(guān)申請保護前必須進(jìn)行知識產(chǎn)權備案。但是，考慮到海關(guān)在依職權保護知識產(chǎn)權時(shí)，需要有足夠的信息保障，修訂后的《條例》仍然規定，知識產(chǎn)權備案是海關(guān)依職權保護的前提條件。
雖然事先不進(jìn)行知識產(chǎn)權備案，知識產(chǎn)權權利人仍然可以向口岸海關(guān)申請扣留侵權嫌疑貨物。但是，備案與否在實(shí)踐中還是有一定的的差異。事先進(jìn)行知識產(chǎn)權的意義主要體現在：
   （一）是海關(guān)主動(dòng)保護的前提條件。根據《條例》的規定，知識產(chǎn)權權利人如果事先沒(méi)有將其知識產(chǎn)權向海關(guān)備案，海關(guān)發(fā)現侵權貨物即將進(jìn)出境，也沒(méi)有權力主動(dòng)中止其進(jìn)出口，也無(wú)權對侵權貨物進(jìn)行調查處理。這一點(diǎn)對商標權和著(zhù)作權的保護方面特別重要；
   （二）有助于海關(guān)發(fā)現侵權貨物。盡管根據《條例》的規定，知識產(chǎn)權權利人在進(jìn)行備案后，仍然需要在發(fā)現侵權貨物即將進(jìn)出境時(shí)向有關(guān)海關(guān)提出采取保護措施的申請，但是，從實(shí)踐看，海關(guān)能否發(fā)現侵權貨物，主要依賴(lài)于海關(guān)對有關(guān)貨物的查驗。由于知識產(chǎn)權權利人在備案時(shí)，需要提供有關(guān)知識產(chǎn)權的法律狀況、權利人的聯(lián)系方式、合法使用知識產(chǎn)權情況、侵權嫌疑貨物情況、有關(guān)圖片和照片等情況，使海關(guān)有可能在日常監管過(guò)程中發(fā)現侵權嫌疑貨物并主動(dòng)予以扣留。所以，事先進(jìn)行知識產(chǎn)權備案，可以使權利人的合法權益得到及時(shí)的保護；
   （三）知識產(chǎn)權權利人的經(jīng)濟負擔較輕。根據海關(guān)總署有關(guān)《知識產(chǎn)權海關(guān)保護條例》的實(shí)施辦法規定，在海關(guān)依職權保護模式下，知識產(chǎn)權權利人向海關(guān)提供的擔保最高不超過(guò)人民幣10萬(wàn)元。如果知識產(chǎn)權權利人事先未進(jìn)行知識產(chǎn)權備案，則不能享受上述待遇，必須提供與其要求扣留的貨物等值的擔保；
    （四）可以對侵權人產(chǎn)生震懾作用。由于海關(guān)對進(jìn)出口侵權貨物予以沒(méi)收并給予進(jìn)出口企業(yè)行政處罰，盡早進(jìn)行知識產(chǎn)權備案，可以對那些過(guò)去毫無(wú)顧忌地進(jìn)出口侵權貨物的企業(yè)產(chǎn)生警告和震懾作用，促使其自覺(jué)地尊重有關(guān)知識產(chǎn)權。此外，有些并非惡意出口侵權產(chǎn)品的企業(yè)也可能通過(guò)查詢(xún)備案，了解其承攬加工和出口的貨物是否可能構成侵權。